Ο Shri Krishna Pattabhi Jois γεννήθηκε στην πανσέληνο του Ιουλίου το 1915, την ημέρα Guru Purnima. Το χωριό των προγόνων του, το Kowshika, κοντά στο Hassan στην πολιτεία της Karnataka, κατοικείται από περίπου 500 άτομα και έχει έναν κεντρικό δρόμο. Στη μια άκρη του δρόμου βρίσκεται ένας ναός του Vishnu, ακριβώς δίπλα στο σπίτι του Pattabhi Jois. Πιο πέρα, στο τέλος του δρόμου, μόλις 100 μέτρα μακριά, βρίσκεται ένας μικρός ναός του Ganapati και ακριβώς απέναντι ένας ναός του Siva. Και οι δύο χρονολογούνται αρκετές εκατοντάδες χρόνια πριν και είναι το επίκεντρο του χωριού.

Ο πατέρας του Pattabhi Jois ήταν ένας αστρολόγος και ιερέας, ο οποίος έδρασε ως pujari για πολλές οικογένειες του χωριού. Από νεαρή ηλικία, όπως τα περισσότερα αγόρια των βραχμάνων, ο Pattabhi Jois διδάχτηκε τις Βέδες και τις ινδουιστικές τελετουργίες.

Όταν ο Guruji ήταν 12 ετών, παρακολούθησε μια επίδειξη yoga στο γυμνάσιό του στο Hassan. Την επόμενη μέρα πήγε να συναντήσει τον σπουδαίο yogi που είχε κάνει την επίδειξη, έναν άντρα με το όνομα Shri T. Krishnamacharya που είχε διδαχθεί yoga για σχεδόν οκτώ χρόνια από τον γκουρού του, τον Rama Mohan Brahmachari, σε μια σπηλιά στο Θιβέτ. Για τα επόμενα δύο χρόνια, ο Guruji διδάχθηκε καθημερινά από τον γκουρού του. Όταν ο Guruji έγινε 14 ετών, μυήθηκε στην βραχμανική τελετή του νήματος. Ο Krishnamacharya έφυγε από το Hassan για να ταξιδέψει και να διδάξει, και ο Guruji άφησε το χωριό του για να πάει στο Mysore.

Ο Guruji επιθυμούσε να παρακολουθήσει μαθήματα Σανσκριτικών στο Πανεπιστήμιο του Mysore. Με δύο ρουπίες στην τσέπη του, έφυγε με δύο φίλους. Ταξίδεψαν με ποδήλατο για περισσότερα από 100 χιλιόμετρα, μέσα από χωματόδρομους. Tα πρώτα ένα δύο χρόνια, η ζωή του ήταν πολύ δύσκολη. Με πολύ λίγα χρήματα, ζητούσε φαγητό σε διάφορα σπίτια Βραχμάνων. Ο Guruji παρακολούθησε μαθήματα και ολοκλήρωσε τις σπουδές του. Στη συνέχεια, περίπου το 1930, πήγε σε μια επίδειξη yoga και είδε ότι ήταν ο γκουρού του. Παρουσιάστηκε μπροστά του με σεβασμό, ξεκινώντας εκ νέου τη σχέση τους και ο Guruji τη μαθητεία του στη yoga.